The GlyCosmos Portal: a unified and comprehensive web resource for the glycosciences
Yamada I, Shiota M, Shinmachi D, Ono T, Tsuchiya S, Hosoda M, Fujita A, Aoki NP, Watanabe Y, Fujita N, Angata K, Kaji H, Narimatsu H, Okuda S, Aoki-Kinoshita KF.
Nat Methods. 2020 Jul;17(7):649-650.
https://doi.org/10.1038/s41592-020-0879-8
GlyCosmos糖鎖科学ポータルは、様々な異なるウェブリソースから得られる糖鎖科学データにアクセスするための統合的なウェブリソースで、糖鎖関連遺伝子、タンパク質、脂質、糖鎖、パスウェイ、疾患などの情報を閲覧することができます。GlyCosmosには、リポジトリと、様々な糖鎖関連データベースや統合データセットを含むデータリソースのセクションがあります。
リポジトリとしては糖鎖構造を登録し固有の識別子を付与する国際糖鎖構造リポジトリGlyTouCan、糖鎖関連の質量分析生データなどを登録するGlycoPOST、アノテーションされた糖鎖構造を登録するUniCarb-DRなどを利用できます。上述したデータリソースはGlyCosmos内部で連携しているのみではなく、ライフサイエンス分野の代表的なデータリソースとつながっています。本論文では、GlyCosmosについて紹介しています。